Por otro lado, el Partido Acción Nacional (PAN), el Partido Revolucionario Institucional (PRI) y Movimiento Ciudadano (MC) perdieron una diputación plurinominal cada uno. Esto significa que el PAN pasa de tener 7 a 6 escaños, el PRI se queda con un solo escaño al igual que MC. Mientras que partidos aliados de Morena, como el Partido Verde Ecologista de México (PVEM) y el Partido del Trabajo (PT), continúan sin diputaciones plurinominales.

Esta decisión se basó en el análisis de los porcentajes de votos y la distribución previa hecha por el Instituto Electoral del Estado (IEE), que fue impugnada por varios partidos debido a una sobrerrepresentación de Morena y aunque esta resolución puede ser apelada, Morena ya logró consolidar una supermayoría en el Congreso de Puebla.

Las impugnaciones fueron presentadas por el PAN, PRI, PVEM, y PT porque consideraban que Morena tenía una sobrerrepresentación en el Congreso de Puebla, sin embargo, el TEEP determinó, al revisar los criterios utilizados por el IEE para asignar los escaños plurinominales, que Morena debía recibir tres diputaciones más en lugar de perderlas.

La razón principal de esta decisión es que el tribunal consideró que los criterios utilizados por el IEE no eran correctos o justos en su asignación original y esto resultó en una reconfiguración que benefició a Morena, dándoles más escaños y afectando a otros partidos; básicamente, aunque las impugnaciones buscaban reducir los escaños de Morena, el análisis del TEEP concluyó que, bajo las reglas electorales vigentes, Morena tenía derecho a un mayor número de diputaciones.

La controversia ahora se centra en si estos partidos impugnantes llevarán el caso a instancias superiores, como la Sala Regional o la Sala Superior del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación (TEPJF), para intentar revertir esta decisión y buscar una nueva redistribución.